Title: Памятка о порядке выполнения курсовых работ
Author: aba
Last saved by: administrator
Company: msu

Тема курсовой работы  для __1__ студента 2-3 курсов ФББ МГУ        
                                           Число приглашаемых студентов 
Тьютор:  заведующий лабораторией электрогенных процессов, докт. биол. наук Алексей Юрьевич    Семенов 

где работает 	‮ НИИ физико-химической биологии им. А.Н. Белозерского
как связаться: e-mail       semenov@genebee.msu.ru                                                                    .   		тел.    939-31-88         ..   корпус    А       .  комн.  413    .  удобное время 13-17 часов
                                                                                                                                                                                                       Тема работы: Анализ закономерностей аминокислотного окружения редокс-кофакторов в мембранных белках.   
Характер работы √ биоинформатика   - анализ трехмерных структур пигмент-белковых комплексов электрон-транспортных цепей_‮ 
Аннотация, 
    В фотосинтетических и дыхательных электрон-транспортных цепях важную роль играют энергетические характеристики реакций переноса электронов (свободная энергия реакции ΔG, значения среднеточечных окислительно-восстановительных потенциалов E_m и т.п.). Установить эти параметры реакций переноса электронов можно как с помощью различных экспериментальных подходов (прямых и косвенных), так и с использованием расчетных методов. Во многих случаях прямое экспериментальное определение редокс-потенциалов невозможно. В то же время знание термодинамики процесса переноса зарядов необходимо для выяснения молекулярных механизмов функционирования белковых комплексов. При расчетах необходимо учитывать структуру белка, осуществляющего перенос зарядов, в том числе — аминокислотное окружение его редокс-кофакторов. В связи с этим представляет интерес выявление закономерностей в окружении одинаковых редокс-кофакторов в разных белках. В рамках курсовой работы предлагается провести анализ основных редокс-активных белков, структуры которых представлены в банке PDB. Необходимо проанализировать ближайшее окружение различных редокс-кофакторов в разных белках, устновить, имеется ли какая-либо закономерная взаимосвязь характера окружения (полярные или неполярные аминокислоты, возможность образования водородных связей и т.п.) с химической природой кофактора (порфирины, хиноны, железо-серные кластеры и т.п.) и функциональными свойствами белка (значения E_m, характерные времена переноса электрона и т.п.).  
                                                                                                                                                                              .   
.