Занятие 1. Химическое строение нуклеиновых кислот

На диске H создайте директорию Term3 и в ней поддиректорию Practice1.

  1. В программе Chemsketch создайте файл "nucl" и, используя набор заготовок, постройте цепь ДНК, состоящую из 4 нуклеотидов T,C,A,G. Перенумеруйте углероды дезоксирибозы. Выделите тёмно-красным цветом те химические связи, которые описывают ход сахаро-фосфатного остова. Выделите сиреневым азоты оснований, связанные с остовом. Подпишите 3’ и 5’ концы вашей цепи.
     
  2. На новой странице вашего файла постройте, используя набор заготовок, химическую структуру уридина и псевдоуридина (внимание: это основания РНК).

    Какие водородные связи могли бы образовываться между пуриновыми (A,G) и пиримидиновыми (T,C) основаниями?
     

  3. На новых листах для каждой пары пурин-пиримидин (всего 4 варианта) изобразите наилучшую по числу водородных связей плоскую конфигурацию оснований. Водородные связи нарисуйте пунктиром. Если вариантов два или более, то изобразите все. Одна пара оснований — один лист. Донорами водорода являются группы NH2 и NH, а акцепторами водорода — те атомы О и N, которые не связаны с водородом.

    Отметьте канонические пары. Если Вы не знаете, какие из пар канонические, то отметьте те, которые, по вашему мнению, наиболее оптимальны.

См. подсказки.