Уважаемые студенты первого курса!
Зачет за второй блок второго семестра по курсу биоинформатики вы сможете
получить, если до указанной ниже даты преподаватели смогут обнаружить на
вашем веб-сайте страницы с отчетом о проделанной работе.
| Группа | Дата сдачи |
| I | 4 апреля 2006 |
| II | 5 апреля 2006 |
| III | 7 апреля 2006 |
Содержание веб-страниц с отчетом о проделанной работе
На странице второго семестра должны появиться подзаголовки "Блок 1" и "Блок 2",
и под вторым — 3 новые гиперссылки:
- Ссылка на страничку с отчетом о выполнении
заданий занятия 6 и дополнительного задания (см. ниже).
Отчет должен включать ссылку на файл matrix.xls. Название ссылки
— "Матрица переходов глобального выравнивания" (соотв.,
"матрицы переходов глобального и локального выравнивания",
если вы делали дополнительное задание)
- Ссылка на страничку с отчетом о выполнении заданий занятия 7, название
ссылки "Программы построения выравниваний"
- Ссылка на страничку с отчетом о выполнении заданий занятия 8,
название ссылки "Работа с программой BLAST"
Дополнительное задание
В файле matrix.xls назовите лист со схемой переходов для глобального
выравнивания "global". Вставьте в книгу новый лист "local" и на нем
создайте схему переходов для локального выравнивания тех же последовательностей
(алгоритм Смита – Ватермана), при тех же параметрах,
что в задании занятия 6. В отчете приведите лучшее выравнивание, его вес и
свои наблюдения.
Оценка зачетного задания
Максимальное количество баллов за это зачетное задание —
25 баллов: по 6 баллов за каждое из трех заданий, 4 балла за дополнительные задания
(упражнения 4 и 5 занятия 8 и схему переходов локального выравнивания)
+ 3 балла за общее оформление; еще 10 баллов
даются за контрольную. Минимальный зачетный балл: 1 за оформление, 5 за контрольную,
по 3 за каждое из трех заданий и в сумме не менее 20.