Занятие 6. Построение схемы переходов глобального выравнивания

 
     

 

Создайте Excel-книгу "matrix.xls" и в ней постройте схему переходов глобального выравнивания для следующих 2-х последовательностей:
1) Последовательность первых 4-х остатков вашего белка.
2) Последовательность из 5 букв, полученную следующим образом: внесите в последовательность первых 4-х остатков вашего белка две любые замены и в произвольном месте вставьте дополнительную букву.

Выделите оптимальный путь цветом. В протоколе приведите выравнивание, соответствующее оптимальному пути, и вес выравнивания; опишите свои наблюдения. Параметры для построения схемы переходов: вес совпадения = 2, вес замены = –1, штраф за гэп = –2.

См. указания.