Занятие 6. Классификация функций. Коды ферментов.

Дополнительные упражнения

  1. Используйте средства специализированного ресурса Brenda для характеристики заданного Вам фермента (1 балл)

    2. Все упражнение выполняйте используя опцию "Quick search" , т.е. стартуя с главной странички.

    Проведите поиск заданного Вам фермента по его коду. Нужно получить 1 строчку, в которой можно найти ссылки на схему ферментативной реакции, перечень всех последовательностей и полное описание. Скопируйте рисунок со схемой ферментативной реакции для отчета. В отчете ответьте также на следующие вопросы:

    1. Сколько всего ферментов с таким кодом описано в БД?
    2. Какая субъединичная структура характерна для ферментов данного типа?
    3. Какие бывают пострансляционные модификации у таких ферментов?
    4. Какие болезни человека так или иначе связаны с данным ферментом?

  2. Сравните аннотации функций в БД GOA у 3-х ферментов из далеких организмов. Сравните эти аннотации с аннотациями в UniProt (2 балла)

    3. Работать надо с теми белками, которые были найдены и исследованы в обязательном упражнении №2. В отчете надо привести запросы.

  3. Используйте средства специализированного ресурса Brenda для сравнения cвойств 2-х ферментов из далеких организмов (1 балл)

    4. Выберите любые 2 фермента из исследованных в упр.2. Сравните оптимум рН этих ферментов. Определите, известны ли ингибиторы и активаторы данных ферментов.