Материалы к занятию 11
Указания и подсказки
1. Скрипт (синоним – «сценарий»)
— это текстовый файл, который программа понимает как набор
последовательных команд.
Для создания скриптов надо использовать
редактор FAR Manager. В текстовый файл mystructure.spt
строчка за строчкой внесите все те команды, которые вы выполнили,
чтобы получить нужное изображение. Пример простейшего скрипта:
restrict none select all wireframe pause select protein wireframe off backbone echo Enjoy the picture! |
Как включить и выключить изображение в шариковой, остовной и ленточной моделях, см. в презентации.
Подсказка: первые две строки вашего скрипта рекомендуется сделать точно такими же, как в приведённом примере.
2. Сначала выполняйте команды непосредственно из командного окна; убедившись, что они дают нужный эффект, заносите их в скрипт.
Постоянно следите за тем, какое именно множество является выделенным в данный момент!
3. Подписать название и номер остатка (например, аргинина номер 57 из цепи B) можно последовательностью команд:
select Arg57:B.CA label %n%r
(в данном случае подпись будет расположена возле изображения Сα-атома).
Как создавать подписи иного вида, смотрите в RasMol Help (в меню графического окна выберите Help →User manual → Command Reference → label).
4. Перед экспортом картинки в виде GIF-файла рекомендуется сделать фон белым