Занятие 6. Функции генов и их продуктов. Онтологии, GO

Дополнительные упражнения

  1. Описание функции белка в БД EcoCyc
  2. Сначала повторите обязательное упр. 2 для Вашего белка из E.coli. Затем изучите описание функции того же белка в БД EcoCyc.

    Добавьте к таблице из упр. 2 еще один столбец, назовите его "Данные EcoCyc". Информацию, на Ваш взгляд, существенно дополняющую аннотацию GO, внесите в соответствующие ячейки таблицы.

  3. Исследование качества аннотации группы белков в UniProt
  4. Определите, какие коды соответствуют экспериментальным, а какие чисто электронным (компьютерным) доказательствам функции, см. подробная расшифровка кодов. Определите долю "чисто компьютерных" аннотаций GO в UniProt для заданной группы белков. Задание не такое простое, как кажется! Запрос и описание дополнительных методов (если они, конечно, понадобятся) приводить обязательно!