Подсказки к заданиями первого занятия первого блока


Подсказки к заданиям 1-3

  1. Общие

    Найти нужный шаблон можно с помощью кнопок Template > Template Window > DNA/RNA Kit.

    Пронумеровать атомы можно с помощью кнопки # в режиме Structure.
    Щелчок по кнопке откроет меню с возможными вариантами нумерации. Если предложенный по умолчанию вариант разумен, то нажмите кнопку ОК. Затем щелкая по атомам в нужном порядке получите желаемую нумерацию. Стереть номера можно с помощью кнопок Tools->Clear Numbering.

    Для выделения атомов и/или связей цветом дважды щелкните по выделенному фрагменту. Двойной щелчок вызывает меню Properties, в котором нужно выбрать цвет и нажать кнопку Apply.

    Для сдвига или поворота выделенного фрагмента используйте кнопки Select/Move и Select/Rotate в режиме Structure. При повороте выделенного удобно также использовать инструменты Set Bond Vertically/Horizontally.

    Прерывистые линии проще нарисовать в режиме DRAW.

    Для создания подписей и/или текста комментария перейдите в режим Draw и щелкните по 3-ей кнопке снизу в левом меню-столбце

  2. К отдельным упражнениям

    При выполнении упр.1 обратите внимание на то, какое из соединений - нуклеотид, а какое - нуклеозид, а также на то, что уридин и псевдоуридин встречаются обычно в РНК!

    Рекомендуемый порядок действий при выполнении упр.2:
    (1) скопируйте на лист в нужном количестве подходящие шаблоны,
    (2) соедините остатки фосфорилированных сахаров, выделите их цветом, (см. выше)
    (3) подпишите основания,
    (4) соедините основания с остовом и надпишите 5' и 3' концы.