Из нижеследующего списка протеобактерий выберите 7–8 названий.
| Название | Мнемоника |
| Bradyrhizobium japonicum | BRAJA |
| Agrobacterium tumifaciens | AGRRK |
| Rhizobium etli | RHIEC |
| Rhodobacter sphaeroides | RHOS4 |
| Burkholderia cenocepacia | BURCA |
| Ralstonia pickettii | RALPJ |
| Neisseria meningitidis | NEIMA |
| Pseudomonas aeruginosa | PSEAE |
| Enterobacter sp. 638 | ENT38 |
| Erwinia carotovora | ERWCT |
| Escherichia coli | ECOLI |
| Salmonella typhimurium | SALTY |
| Yersinia pestis | YERPE |
| Yersinia pseudotuberculosis | YERPS |
| Vibrio cholerae | VIBCH |
| Vibrio fischeri | VIBFM |
| Haemophilus influenzae | HAEIN |
| Pasteurella multocida | PASMU |
| Proteus mirabilis | PROMH |
Руководствуясь приведённым филогенетическим деревом, нарисуйте дерево выбранных вами организмов:
Приведите в отчёте: а) скобочную формулу; б) изображение; в) список нетривиальных ветвей как разбиений множества листьев.
Напоминание: мы называем ветвь нетривиальной, если она разбивает множество листьев на подмножества, в каждом из которых более одного элемента.
В представлениях дерева удобно пользоваться краткими мнемоническими обозначениями видов (правая колонка таблицы). Но если вы будете их использовать, в отчёте обязательно должна присутствовать их расшифровка, то есть таблица отобранных видов с указанием мнемонического обозначения каждого вида.
Совет по созданию изображения. Можно, конечно, нарисовать дерево в каком-нибудь графическом редакторе. Но рисунок получится красивее, а вы сэкономите усилия, если поступите следующим образом. Нарисуйте дерево ручкой на бумаге. Затем создайте файл со скобочной формулой (желательно, чтобы имя файла имело расширение .tre) и откройте его программой TreeDyn.
Занятие 1Отобранные бактерии
Скобочная формула дерева(PSEAE,(ERWCT,(ENT38,(ECOLI,SALTY)))); Изображение дерева Ветви дереваДерево содержит две нетривиальные ветви:1) {PSEAE, ERWCT} против {ENT38, ECOLI, SALTY} 2) {PSEAE, ERWCT, ENT38} против {ECOLI, SALTY} |