Вопросы к коллоквиуму по рентгеноструктурному анализу

1. Основные этапы определения структуры методом РСА.
2. Что такое кристалл с точки зрения его электронной плотности?
3. Что такое элементарная ячейка кристалла?
4. Что такое кристаллографическая симметрия?
5. Что такое некристаллографическая симметрия (структуры в кристалле)?
6. Условия Лауэ (на направления, в которых наблюдается дифракция на кристалле).
7. Абсолютные и относительные координаты.
8. Напишите формулу для синтеза Фурье электронной плотности кристалла и объясните смысл использованных обозначений.
9. Как связаны индексы рефлекса h, k, l и соответствующий им вектор рассеяния s?
10. Напишите формулу, выражающую зависимость одной гармоники Фурье от вектора r (из начала координат в данную точку). (Л3, слайд 6).
11. Разрешение гармоники Фурье.
12. Дан набор измеренных в эксперименте модулей структурных факторов. Как определить разрешение структуры?
13. В чём состоит фазовая проблема?
14. Перечислите основные методы решения фазовой проблемы.
15. Метод изоморфного замещения: какие дополнительные эксперименты требуется провести?
16. Что требуется для применения метода аномального рассеяния?
17. Суть метода молекулярного замещения.
18. Комбинированный синтез Фурье (в методе молекулярного замещения).
19. Что такое температурный фактор (B-фактор)?
20. Что такое коэффициент заполнения атома и почему он не всегда равен 1?
21. Перечислите основные показатели качества рентгеноструктурной модели.
22. Как проводится оптимизация структуры? R-фактор.
23. Свободный R-фактор (R_free): как считается, зачем нужен.
24. Карта Рамачандрана и её использование для оценки качества модели.
25. Как по модели и модулям структурных факторов вычисляется "экспериментальная" электронная плотность (для визуализации и оценки моделирования отдельных остатков)?
26. Пространственный R-фактор.
27. Как вычисляется Z-score пространственного R-фактора?