Из нижеследующего списка бактерий семейства Firmicutes выберите 7–8 названий.
| Название | Мнемоника |
| Bacillus anthracis | BACAN |
| Bacillus subtilis | BACSU |
| Clostridium botulinum | CLOB1 |
| Clostridium tetani | CLOTE |
| Enterococcus faecalis | ENTFA |
| Finegoldia magna | FINM2 |
| Geobacillus kaustophilus | GEOKA |
| Lactobacillus acidophilus | LACAC |
| Lactobacillus delbrueckii | LACDA |
| Lactococcus lactis | LACLM |
| Listeria monocytogenes | LISMO |
| Pediococcus pentosaceus | PEDPA |
| Staphylococcus aureus | STAA1 |
| Staphylococcus epidermidis | STAES |
| Streptococcus pyogenes | STRP1 |
| Streptococcus pneumoniae | STRPN |
| Thermoanaerobacter tengcongensis | THETN |
Руководствуясь приведённым филогенетическим деревом, нарисуйте дерево выбранных вами организмов:
Приведите в отчёте: а) скобочную формулу; б) изображение; в) список нетривиальных ветвей как разбиений множества листьев.
Напоминание: мы называем ветвь нетривиальной, если она разбивает множество листьев на подмножества, в каждом из которых более одного элемента.
В представлениях дерева удобно пользоваться краткими мнемоническими обозначениями видов (правая колонка таблицы). Но если вы будете их использовать, в отчёте обязательно должна присутствовать их расшифровка, то есть таблица отобранных видов с указанием мнемонического обозначения каждого вида.
Совет по созданию изображения. Можно, конечно, нарисовать дерево в каком-нибудь графическом редакторе. Но рисунок получится красивее, а вы сэкономите усилия, если поступите следующим образом. Нарисуйте дерево ручкой на бумаге. Затем создайте файл со скобочной формулой (имя файла должно иметь расширение .tre) и откройте его программой MEGA.
Занятие 1Отобранные бактерии
Скобочная формула дерева(CLOTE,((BACSU,LISMO),(LACLM,STRPN))); Изображение дерева Ветви дереваДерево содержит две нетривиальные ветви:1) {BACSU, LISMO} против {CLOTE, LACLM, STRPN} 2) {CLOTE, BACSU, LISMO} против {LACLM, STRPN} |