Поисковые системы
1.Найти белок в банке SwissProt, пользуясь тремя поисквыми системами
MRSSRS
UniProt
Все три поисковые системы предоставляют практически идентичную информацию. Однако, например:
-В SRS большая часть информации уделена ссылкам на статьи, благодаря чему работы может упроститься
-В UniProt можно посмотреть вторичную структуру белка
-В SRS последовательность может быть в форматах FASTA, GCG, PIR, Pretty.
2.Страница с описанием поля "Taxonomy" банка SwissProt
-Названия таксонов, начинающихся с Bacil:bacillaceae
bacillales
bacillariaceae
bacillariales
bacillariophyceae
bacillariophycidae
bacillariophyta
bacillus
-Сколько в банке SwissProt записей, описывающих белки из рода Bacillus? 15224
-
Сколько в банке SwissProt записей, описывающих белки из отдела Firmicutes? 67277
3.Белки из Firmicutes, выполняющие функцию, сходную с фенкцией моего болкa
| Формулировка функции белка | Строка запроса | Количество найденных документов |
|---|---|---|
| Верятно вовлечен в рибонуклеотидную функцию редуктазы | (([swissprot-Taxonomy:firmicutes*] & [swissprot-Description:ribonucleotide*]) & [swissprot-Description:reductase*]) | 5 |