Программы пaкета BLAST

Меню
Главная
Проекты
Семестр 3
Заметки
Обо мне
Ссылки
Официальный Сайт МГУ
Официальный сайт ФББ
Сервер Kodomo
Моя почта

Число находок с E-value < 0,001

 2

E-value лучшей находки

1e-10

Название последовательности с лучшей находкой

embl|AL766845|AL766845 Streptococcus agalactiae NEM316 complete genome, segment 3

Координаты лучшей находки (от-до)

от 100467 до 100658

Процент последовательности белка, вошедший в выравнивание с лучшей находкой

92%

Нахождение записи EMBL по последовательности программой BLASTN

Запись EMBL: EM_PRO:U14003.
Координаты: 90380 - 90559. Соответствует, так как номера идут в порядке возрастания.
Имеется участок, включающий данную последовательность, в том же направлении, что и данная последовательность.
Это участок 90080-91030, который кодирует тРНК дельта-2-изопентенилпирофосфат трансферазу.

Поиск гомологов гена программой BLASTN

Число находок: 2
E-value лучшей находки: 0,057
Название: embl|AL766850|AL766850 Streptococcus agalactiae NEM316 complete genome, segment 8
Координаты: 160403 - 160430

Вывод: Поиск гомологов по последовательности белка дал лучший результат по сравнению с поиском по гену в отношении e-value лучшей находки, длинней перекрытия искомой и входной последовтельности.
© Atrokhova Anastasia/Атрохова Анастасия