Умения - D5



D5: Сравнение доменов SCOP и Pfam

Я произвела поиск для структуры 2C2R в SCOP и Pfam.
Pfam показал наличие двух доменов: IMS (6-156) и IMS_C (234 - 347)
Поиск в SCOP дал два домена: d2c2ra2 (1-240) и d2c2ra1 (241-342)
Как можно заметить, домены в Pfam меньше, и домены SCOP может даже включать их в себя. Это объясняется тем, что в SCOP расположены структурные домены, а в Pfam - функциональные.



Рис. 1. Структура 2C2R, домены SCOP



Рис. 2. Структура 2C2R, домены Pfam