Семестр 2. Блок 1. Занятие 2.



Задание 1.

  Метка поля Содержание
Код(ы) доступа ("Accession number") AC P96622; Q797K4
Идентификатор записи в БД ID ENDOA_BACSU
Название (краткое описание) белка DE Full=Endoribonuclease EndoA (Эндорибонуклеаза)
EC=3.1.-.-
Дата создания документа DT 01-MAY-1997
Дата последнего исправления аннотации DT 30-NOV-2010
Число публикаций, использованных при создании документа RN 4
Журнал и год самой поздней публикации RL Mol. Microbiol. 56:1139-1148 (2005)
Ключевые слова KW 3D-structure; Complete proteome; Endonuclease; Hydrolase; Nuclease; Toxin.
Что содержит поле комментариев? CC SUBUNIT: Part of the toxin-antitoxin system EndoA/EndoAI
(Субъединица: Часть системы: токсин - антитоксин EndoA/EndoAI)
SIMILARITY: Belongs to the pemK family
(Сходство: принадлежит семейству pemK ) FUNCTION: Yields cleavage products with 3' phosphate and 5' hydroxyl groups. Overexpression is toxic for cell growth, probably by inhibiting protein synthesis through the cleavage of single- stranded RNA. The toxicity is reversed by the antitoxin EndoAI. (Функции:Результат расщепления 3' фосфат и 5' гидроксил групп. Сверхэкспрессия является токсичной для роста клеток, вероятно, из-за ингибирования синтеза белка путем расщепления одноцепочной РНК.Токсичность отменена антитоксином EndoAI )
Идентификаторы записей PDB DR 1NE8

Задание 2.

Этот белок входит в систему токсин-антитоксин EndoA/EndoAI

Задание 3.

Запрос Число записей в SwissProt Число записей в TrEMBL
"Endoribonuclease EndoA" 1 78
EC=3.1.-.- 17339 80078

Задание 4.

 Метка поляБелок 1Белок 2
Первый код доступа AC P96622; Q797K4 B1HY44
Идентификатор последовательности в БДID ENDOA_BACSU B1HY44_LYSSC
Название (краткое описание) белкаDE Full=Endoribonuclease EndoA EC=3.1.-.- SubName: Full=Endoribonuclease EndoA; EC=3.1.-.-;
Дата создания документаDT 01-MAY-1997 29-APR-2008
Дата последнего исправления аннотацииDT 30-NOV-201030-NOV-2010
Название организмаOSBacillus subtilisLysinibacillus sphaericus (strain C3-41
Классификация организма (список таксонов)OC Bacteria; Firmicutes; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus.Bacteria; Firmicutes; Bacillales; Bacillaceae; Lysinibacillus
Длина последовательностиSQ 116116
Молекулярная масса белкаSQ 1297812819
Число публикаций, использованных при создании документаRN 4 1
Журнал и год самой поздней публикацииRL Mol. Microbiol. 56:1139-1148 (2005) J. Bacteriol. 190:2892-2902(2008)
Описание вторичной структурыFT CHAIN 1 116 Endoribonuclease EndoA.
/FTId=PRO_0000201900.
STRAND 7 12
STRAND 23 29
HELIX 33 38
STRAND 40 50
STRAND 59 62
HELIX 64 67
STRAND 73 84
HELIX 85 87
HELIX 97 110
нет
Ключевые словаKW3D-structure; Complete proteome; Endonuclease; Hydrolase; Nuclease; Toxin. Complete proteome; Hydrolase
Темы, освещённые в комментарияхCCSUBUNIT SIMILARITY FUNCTION нет
Особенности последовательностиFTнетнет
Идентификаторы записей PDB DR 1NE8 нет

Задание 5. Оба белка имеют одинаковое название, одинаковую длину аминокислотной последовательности, примерно равную массу, однако из разных организмов.


© SHADRINA О. А. 2010