Анализ выравнивания. Поиск диагностических позиций



Задание 4.

Былo полученo выравниваниe , подкрашены консервативные позиции внутри таксонов. Рассмотрим диагностические позиции на участке 1-300 выравнивания

Часто в пределах таксона происходит замена остатков с одинаковыми свойствами. Например, в позиции 186: у Lactobacillaceae аспарагиновая кислота, у Streptococcaceae глутаминовая кислота, а у Bacillaceae- тирозин. При этом D, E (полярные, отрицат. заряж.) являются сходными остатками, а семейства Lactobacillaceae и Streptococcaceae объединены в порядок Lactobacillales.

Так как порядки Lactobacillales и Bacillales входят в класс Bacilli, то можно найти диагностические позиции и для этого таксона.


© SHADRINA О. А. 2011