Задание 1. Описание выбранного домена: Thioesterase domain
| AC | PF00975 |
|---|---|
| ID | Thioesterase domain |
| Функция | Тиостеразный домен встречается в синтетазах, вовлеченных в нерибосомальный синтез белковых антибиотиков. Тиостеразы необходимы для добавления последней аминокислоты к пептиду, формируя циклическую структуру. |
| Число доменных архитектур | 434 |
| Число PDB структур | 22 |
| Число белков | 3948 |
| В Pfam | Ссылка |
|
Таксон
|
Количество видов.
|
|
| Эукариоты | Зеленые растения | 9 |
| Грибы | 103 | |
| Животные | 54 | |
| Остальные эукариоты | 7 | |
| Археи | 1 | |
| Бактерии | 1335 | |
| Вирусы | 0 | |
Проект для выбранного домена.
Задание 2.
Первая выбранная архитектура состоит из 3 доменов: AMP-binding, PP-binding, Thioesterase. Имеет 160 последовательностей.
Состав:
AMP-binding (PF00501)
PP-binding (PF00550)
Thioesterase (PF00975)
Изображение:
Вторая выбранная архитектура состоит из 1 моего домена Thioesterase (PF00975). Является наиболее представленной - 1534 последовательности.
Изображение:
Задание 3.
Полученные таблицы с таксономией представителей выбранных архитектур, полным перечнем белков с выбранным доменом, а также выбранными последовательностями для дальнейшего исследования архитектур: таблица