Филогенетические деревья

Из списка бактерий отдела Firmicutes было выбрано 7 организмов

НазваниеМнемоника
Bacillus anthracisBACAN
Clostridium botulinumCLOB1
Finegoldia magnaFINM2
Geobacillus kaustophilusGEOKA
Lactobacillus delbrueckiiLACDA
Listeria monocytogenesLISMO
Streptococcus pneumoniaeSTRPN


Далее была построена скобочная формула дерева выбранных организмов:

((CLOB1,FINM2),((LACDA,STRPN),((BACAN,GEOKA),LISMO)));

Затем был создан файл со скобочной формулой с расширением .tre и был открыт в программе MEGA. Так было получено изображение дерева(см.Рис1):


Рис.1 Филогенетическое дерево выбранных организмов в прямоугольной форме.

Дерево содержит 4 нетривиальные ветви:
1. {CLOB1,FINM2} vs {LACDA,STRPN,BACAN,GEOKA,LISMO}
2. {LACDA,STRPN} vs {CLOB1,FINM2,BACAN,GEOKA,LISMO}
3. {BACAN,GEOKA} vs {CLOB1,FINM2,LACDA,STRPN,LISMO}
4. {BACAN,GEOKA,LISMO} vs {CLOB1,FINM2,LACDA,STRPN}

© Андреева Анна, 2012 (Последнее исправление: 12.05.2014)