Филогенетическое дерево
В таблице 1 можно найти коды, которые я для удобства присвоила последовательностям.
| Архитектура | Таксон | Код |
| AAA_26 + DRTGG | Cyanobacteria | 1C |
| AAA_26 + DRTGG | Proteobacteria | 1P |
| AAA_26 + DRTGG + PTA_PTB | Actinobacteria | 2A |
| AAA_26 + DRTGG + PTA_PTB | Proteobacteria | 2P |
При помощи метода Neighbor-Joining (нет молекулярных часов, есть длины ветвей) в программе JalView было построено дерево (Рис. 1). Если посмотреть на нижнюю кладу, в которую входят все последовательности из 2A, можно сделать вывод о том, что у предкового организма была трехдоменная архитектура, а затем родоначальники 1С и 1Р потеряли домен PTA_PTB.
Рис.1 Филогенетическое дерево