Исследование стрруктуры аминокислот и пептидов в программе ACD ChemSketch

1. Alanine

На рисунке показаны структурные формулы (слева направо):
плоскостная формула третьей аминокислоты белка Thim_Bacsu - Alanine (аланин),
формула D-alanine,
формула L-alanine.


2. Пространственная структура L- и D-изомеров аланина:



D-alanine	L-alanine


Из плоскости N-Cα-C у L-аланина выходит атом H, а у D-аланина CH₃группа
Отличие этих двух изомеров заключается в следующих пунктах:
• в расположение атомов при αС относительно плоскости N-Cα-C;
• при прохождении плоскополяризованного света через один из изомеров плоскость поляризации света отклоняется влево, в случае с другим изомером - вправо;
• L-изомер синтезируется в живых организмах и используется для построения белковых молекул (D-изомер синтезируется и используется для потроения белковых молекул небольшой группой бактерий).
3. Химическая реакция образования дипептида:


4. Схема пептида


5. Формула фикоцианобилина