ИМЯ ПОЛЯ | MRS | SRS | UniProt |
Вводная информация(Entry information) | вверху страницы | внизу страницы | |
Атрибуты белка (protein attributes) | отсутствует | указана информация о длине белка, статусе последовательности | |
Список литературы (references) | вверху страницы | внизу страницы | |
Особенности (features) | В первой колонке прописаны участки белковой молекулы (key),
во второй - номер первого аминокислотного остатка (from),
в третьей - номер последнего аминокислотного остатка (to),
в четвертой - длинна участка (length), в пятой - описание(Description).
При наведении курсора на любую строку поля особенности (features) в поле информация о последовательности (sequence information) выделяется последовательность аминокислотных остатков. |
Имеется два типа просмотра особенностей: сокращенная (Features compressed) и полная (Features expanded). Имеется цветная шкала, на которой отмечены различные участки цепи. При нажатии на любой из участков на цветной шкале открывается страница с доролнительной информацией о данном участке (в том числе и аминокислотная последовательность). Под шкалой расположено поле в котром прописан каждый из участков в белковой молекуле (содержит те же колонки, что и в MRS). |
Информация о основных участках белка, произведенных мутациях записана таким
же образом как и в MRS, и SRS, отличие - в каждой строке есть прямая, отображающая
молекулу белка, на которой отмечено место расположения данного участка или мутации.
При нажатии на данную прямую открывается окно с аминокислотной последовательностью,
на которой отмечены аминокислоты, входящие в состав данного участка.
Вторичная структура представлена в виде цветной шкалы. При нажатии на участок цепи открывается страница с аминокислотной последовательностью, на которой отмечены аминокислотные остатки, образующие данный вторичный элемент. |
Информация о последовательности (sequence information) | Последовательность аминокислотных остатков записана в виде 6 столбцов по 10 аминокислотных остатков в каждом. | Есть возможность просмотра последовательности FASTA, GCG, PIR, Swiss-Prot, Pretty формате. | Аминокислотная последовательность представлена так же, как и в MRS, но есть возможность просмотра в FASTA формате |
Формулировка функции белка | Строка запроса | Количество найденных документов |
transferase | ([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria*] & [swissprot-AllText:transferase*]) | 25403 |
kinase | ([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria*] & [swissprot-AllText:kinase*]) | 5074 |
Thiamine biosynthesis | ([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria*] & (([swissprot-AllText:thiamine*] & [swissprot-AllText:biosynthesis*]) | [swissprot-AllText:thiamine biosynthesis*])) | 928 |
ATP + 4-methyl-5-(2-hydroxyethyl)thiazole = ADP + 4-methyl-5-(2-phosphonooxyethyl)thiazole. | ([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria*] & (([swissprot-AllText:ATP*] & [swissprot-AllText:ADP])) | 9357 |