SRS

 Задание №1. 
  
 Все три вида записи содержат одну и ту же информацию. Эти виды отличаются оформлением. 
Во- первых разница состоит в цвете. MRS бело-синий, SRS бело-зеленая, EXPASY сине-желтая. 
Во всех видах информация разделена на блоки:                                           
Entry information              
Name and origin of the protein                                                                                       
References
Comments
Copyright
Cross-references
Features
Sequence information
В них тоже есть разница в оформлении.
                                                                                                                                                                                                              
 Мне больше всего понравилось работать с поисковой машиной SRS,тк и цветовая гамма приятная,и                      
довольно удобная система подачи информации, файлы небольшие по размеру и нужную информаццию можно                  
смотреть,переходя по многочисленным ссылкам (файл,выданный поисковой машиной Expasy сложно даже прочесть).       
 Задание №2. 
                                                                                      
Результаты по поиску таксонов,начинающихся с "gam" :                                                        
  Value                 No of Entries                                                                              
  gambusia       	1                                                                                          
  gammaherpesvirinae 	190                                                                                        
  gammapapillomavirus 	30                                                                                         
  gammaproteobacteria 	69659                                                                                      
  gammaretrovirus 	116                                                                                        
  gammaridea    	1                                                                                          
Английский эквивалент таксона "гамма-протеобактерии": gammaproteobacteria.                                         
В банке SwissProt 69659 записей, описывающих белки из гамма-протеобактерий.                                        
 Задание №3. 
 



Формулировка функции белка


Строка запроса


Количество найденных документов






ATP-dependent Clp protease adapter protein clpS    


((((((([swissprot-Description:ATP-dependent*] &  [swissprot-Description:Clp*])       
[swissprot-Description:protein*]) &  [swissprot-Description:clpS*]) |                  
[swissprot-Description:ATP-dependent Clp protease adapter p rotein clpS*]) &           
[swissprot-Taxonomy:Gammaproteobacteria*])                                             
                                                                                         


83
          


                                                                                                                                                                                                                                                                                            
 Задание №4. 
 
Последовательности в fasta-формате, полученные при запросе                                                                                                     
                                     
                                     
                                     
                                     
                                     
                                     

                                                                                                                                                                            

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     
Второй семестр                                                                                                                    
                                                                                                                                                                          
Главная страница                                                                                                                  
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
©                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
Гардиева Алиса,2007