Визуальзация молкулы белка 5GTN(создана с помощью Jmol)
Таблица 1:Параметры водородных связей между остовными атомами азота и кислорода
| Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре | |||
| # | Имена атомов | Длина связи (Å) | Угол N-O-C (°) |
Альфа-спирали |
|||
1 |
[GLU]696:B.N-[ARG]692:B.O |
2.88 |
157.4 |
2 |
[GLN]695:B.N-[HIS]691:B.O |
2.92 |
162.0 |
3 |
[LEU]694:B.N-[LEU]690:B.O |
2.90 |
157.7 |
Бета-тяжи |
|||
1 |
[ILE]249:A.N-[PHE]347:A.O |
2.77 |
155.9 |
2 |
[PHE]347:A.N-[PHE]247:A.O |
2.87 |
145.3 |
3 |
[THR]349:A.N-[ILE]249:A.O |
3.03 |
164.9 |
Из приведенных данных видно, что в общем длина водородной связи колеблется от 2.7 до 3.1 Å,
при среднем значении длины водородной связи в белках равной 2.8Å.
Угол N-O-C
находится в пределах между 145° и 165°.(информация о водородной связи взята из
данного источника ).
Весенний семестр 2018