Учебный сайт Софроновой Алины

Описание генома Echovirus E5

        По типу носителя генома вирус Echovirus E5 классифицируется как ssRNA positive-strand virus, т.е. носителем информации является одноцепочечная РНК позитивной полярности. Последнее означает, что транслируется РНК, которая входит в состав вируса.
        Вирус был впервые выделен из человека.
        Геном этого вируса состоит из одной молекулы РНК и содержится в записи AF083069 банка EMBL. Общее количество нуклеотидов 7433. В геноме закодирован один ген. Информация о гене приведена в таблице 1.

Таблица 1. Гены в геноме вируса Echovirus E5
Начало Конец Ориентация Длина Продукт
1 743 7333 +1 6591 Polyprotein

        Длина гена делится на 3. Графическое изображение всего генома вируса Echovirus E5 приведено на рис.1, а 5’-концевая область гена приведена на рис.2. Первый кодон – ATG. Он соответствует аминокислотному остатку метионина (M).

Рис. 1. 5’-концевая область гена вируса. Геном вируса Echovirus 5. Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI ( http://www.ncbi.nlm.nih.gov )

Рис. 2. Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI ( http://www.ncbi.nlm.nih.gov )

Вернуться к 1 семестру


© Алина Софронова, 2013
Дата последнего изменения: 21.12.2013