Построение поверхности

Учебный сайт Софроновой Алины

Изображения для комплекса пуринового репрессора с ДНК (PDB ID 1bdh):

поверхности контакта мономера белка с симметричным мономером на фоне остовной (ribbon) модели мономера (Рис.1)

Рис.1. Поверхность контакта мономера белка с симметричным мономером на фоне остовной (ribbon) модели мономера
поверхности контакта димера белков с двойной спиралью ДНК на фоне остовной модели части белка, вовлечённой в контакт (Рис.2)

Рис.2. Поверхность контакта димера белков с двойной спиралью ДНК на фоне остовной модели части белка, вовлечённой в контакт
поверхности контакта ДНК с димером белков на фоне проволочной (sticks) модели двойной спирали (Рис.3)

Рис.3. Поверхность контакта ДНК с димером белков на фоне проволочной (sticks) модели двойной спирали

Были определены гидрофобные кластеры объёмом не менее 10 атомов на интерфейсе мономеров белка в том же комплексе (Рис.4) с помощью . программы Clud с порогом на расстояние 5Å.

Рис.4. Гидрофобные кластеры на интерфейсе мономеров

Вернуться к 7 семестру