Учебный сайт Софроновой Алины
Использование сервисов PDB

        При помощи Advances search на сайте PDB были найдены комплексы белка с ДНК-РНК гибридом, причем белок дикого типа, разрешение не более 2.5Å, структура должна содержать лиганд (Рис.1).


Рис.1. Запрос Advances search

        По данному запросу нашлось 13 структур. Был поставлен фильтр на организм Homo sapiens. В результате осталось только 6 структур с идентификаторами 3uq0, 4ndf, 4o9m, 5ev1, 5ev2, 5ev4. Здесь можно посмотреть единый fasta-файл для всех последовательностей. Excel-таблица с информацией о всех PDB файлах можно постмотреть Здесь.



Вернуться к 7 семестру

© Алина Софронова, 2016
Дата последнего изменения: 10.01.2017