Ферменты и метаболические пути. База данных KEGG.

Общие сведения о метаболическом пути биосинтеза лизина

ID карты: map00300

Лизин - одна из канонических незаменимых для человека аминокислот, используется в биосинтезе мышечного белка и не только.

Синтез L-лизина(на рисунке в синем прямоугольнике) идёт двумя путями: из альфа-Кетоглутаровой кислоты (2-Oxoglutarate) и Ацетил-КоА и из аспарагиновой кислоты

Данный путь связан с другими путями через вещества, подчёркнутых красным:
L-Aspartate 4-semialdehyde -> Glycine, serine and threonine metabolism(map00260)
	
meso-2,6-Diaminoheptanedioate -> Peptidoglycan biosynthesis(map00550)

Также L-лизин впоследствии используется для синтеза L-Pyrrolysine, Lysine degradation(map00310), Tropane, piperidine and pyridine alkaloid biosynthesis(map00960)

Метаболический путь биосинтеза лизина в разных доменах жизни

Бактерия: Helicobacter felis(Bacteria; Proteobacteria; delta/epsilon subdivisions; Epsilonproteobacteria; Campylobacterales; Helicobacteraceae; Helicobacter). Она может совершать лишь часть пути, в частности, синтезировать L-homoserine из L-Aspartate.

Архея: Archaeoglobus profundus(Archaea; Euryarchaeota; Archaeoglobi; Archaeoglobales; Archaeoglobaceae; Archaeoglobus). Она может совершать путь от L-Aspartate до L-lysine.

Эукариот: Brassica rapa(Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae; Brassiceae; Brassica). Она может совершать путь от L-Aspartate до L-lysine.

Реакция ATP:L-aspartate 4-phosphotransferase в базе данных KEGG

ID реакции: R00480. Данная реакция показана на перврвом рисунке чёрным овалом.

Дополнителное задание

Мною был рассмотрен данный путь в базе MetaCyc. В ней путь, покаанный в базе KEGG, разбит на несколько отдельных путей. Ниже преставлен один из таких путей. Схема примерно схожа с путём, показанным в базе KEGG.