| |
|
|
Задание 1.
- Информация в MRS очень удобна для визуального восприятия, все четко
и ясно, ничего лишнего, в ней легко разобраться.
- SRS снабжен различными ссылками, например в PubMed, но это затрудняет
чтение(крупные значки), оформление пестрыми цветами несколько отвлекает,
зато аминокислотную последовательность можно просматривать в разных форматах
- это очень удобно. Информация о последовательности также наглядно представлена
в небольшой схеме.
- В UniProt страница удобна для чтения и снабжена заметками(не мешают
чтению). Для белка приведены биофизикохимические свойства. Информация о
последовательности снабжена графическими представлениями, аминокислотная
последовательность для удобства разбита на десятки.
Задание 2
-
- bacillaceae(семейство)
- bacillales(порядок)
- bacillariaceae(семейство)
- bacillariales(порядок)
- bacillariophyceae(семейство)
- bacillariophycidae(класс)
- bacillariophyta(отдел)
- bacillus(род)
- В банке SwissProt 23013 записей, описывающих белки из рода Bacillus.
- В банке SwissProt 67277 записей, описывающих белки из отдела Firmicutes.
Задание 3
| Формулировка функции белка | Строка запроса | Количество найденных документов
|
|---|
| Maltose-6'-phosphate glucosidase
| (([swissprot-Description:Maltose-6'-phosphate*] & [swissprot-Description:glucosidase*]) | [swissprot-Description:Maltose-6'-phosphate glucosidase*])
| 3
| | 6-phospho-alpha-D-glucosidase
| [swissprot-Description:6-phospho-alpha-D-glucosidase*]
| 2
| | Hydrolyzes maltose-6'-phosphate
| ((([swissprot-Comment:Hydrolyzes*] & [swissprot-Comment:maltose-6'-phosphate*]) | [swissprot-Comment:Hydrolyzes maltose-6'-phosphate*]) > pa rent )
| 3
|
Задание 4
сохраненные последовательности в формате фаста
Задание 5
По данным комментариев из списка статей сфера научных интересов А.А. Нейфаха - белок multidrug efflux transporter.
Задание 6
- 18202 записи по запросу grep '^ID^ -c /P/y10/Term_2/Block1/Practice3/bacsu.gbk
- 42 записи по запросу grep '^RN^ /P/y10/Term_2/Block1/Practice3/bacsu.gbk | grep '1[12345]' -c
|