Учебный сайт Безменовой Александры

8 семестр. Молекулярное моделирование

• 2. Работа с Pymol
• 3. Cеми-эмпирические вычисления: Mopac (добавлено задание про тиминовые димеры!)
• 4. Abinitio вычисления
• 5. Вычисление параметров для молекулярной механики
• 7. Изучение работы методов контроля температуры в GROMACS
• 8. Молекулярная динамика биологических молекул в GROMACS (new!)
• 13. Оптимизация структуры с помощью firefly
• 14. Пример использования трехмерного QSAR анализа для предсказания активности низкомолекулярных соединений в отношении данного белка (new!)