Практикумы 3, 4


На данной структуре представлен собственно белок - бета-глюкозидаза. Весь белок представлен только одной цепью, как и биологическая единица в целом. (PDB ID: 2X42)

Данный белок принадлежит гипертермофильной бактерии Thermotoga neapolitana. ID белка в базе Uniprot: Q0GC07. Название молекулы - бета-глюкозидаза. Она учавствует в реакции гидролиза полисахаридов. Относительно референса из Uniprot есть одна мутация. В составе цепи отсутствуют модифицированные аминокислотные остатки.

В записи присутствуют малые молекулы: альфа-глюкоза (GLC), ионы брома (BR). Ссылка на файл с координатами

Ионы брома связались неспецифично из среды во время кристаллизации. Глюкоза же привязывается либо из среды, либо как продукт гидролиза

.
рис. 1 Бета-глюкозидаза со вторичными структурами
.
рис. 2 Окружение молекулы глюзозы