Краткое описание белка formate–tetrahydrofolate ligase

Таб.1: Описание формилтетрагидрофолатсинтазы из
генома бактерии Ruminiclostridium thermocellum

Параметр	Значение
Идентификатор белка	ALX07041.1
Идентификатор генома	CP013828
Координаты гена в геноме	30674..32344
Длина гена (в парах нуклеотидов)	1670
Цепь (прямая или обратная)	complement
Длина белка (в аминокислотных остатках)	556

Краткий обзор белка

Formate-tetrahydrofolate ligase, она же formyltetrahydrofolate synthetase [2] является одним из ферментов, участвующих в межмолекулярном переносе одноуглеродных врагментов, одном из важнейших элементов различных биосинтетических путей. FTHFS катализирует АТФ-зависимую активацию формиат-йона с помощью добавления его в положение N10 из тетрагидрофолата[1].

Данный белок (или сходные с ним) встречается во многих анаэробных прокариотических организмах, в том числе и в бактериях Clostridium thermocellum. В таб.1 представлено краткое описание гена AD2_00030, кодирующего белок formate-tetrahydrofolate ligase.

Последовательность белка formate-tetrahydrofolate ligase

>ALX07041.1 Formate-tetrahydrofolate ligase
mltdiqiaqs ckmkpitqva aelgideeel elygkykakl sdklwervkd rpdgklvlvt
ainptpageg kttttvglgq amarigkkav ialrepslgp vmgikggaag ggysqvvpme
dinlhftgdm haitaannll saaidnhiqq gnelnidvrq iiwkramdmn dralrnivvg
lggkangvpr edgfqitvas evmavlclst glmdlkerlg riligytydg kpvfakdlkv
ngamalllkd aikpnlvqtl entpaivhgg pfaniahgcn sivatrlglk ladyciteag
fgadlgaekf fnikcryagl kpdlvvlvat iralkynggv kkenlgienl palekgfvnl
ekhienirkf qvpllvainh fdtdseaeie yvknrckaln vevafsdvfs kgseggiela
ekvvkltetq ksnfkplydv nlsirekiei iareiygads vnilpaaera ikkieelkmd
klpicvaktq yslsddptll grpqgfvitv reiklssgag fivaitgdim tmpglpkvpa
aekidideng vitglf

Геномное окружение белка formate-tetrahydrofolate ligase

Рис.1: Геномное окружение белка

Можно заметить, что белок закодирован на комплементарной цепи ДНК. Другие гены, находящиеся рядом, отвечают за процесс спорообразования. Они не имеют никакой связи с геном AD2_00030, так как располагаются на противоположной цепи (Рис. 1).

Источники:

[1] Radfar R, Leaphart A, Brewer JM, Minor W, Odom JD, Dunlap RB, Lovell CR, Lebioda L. Cation binding and thermostability of FTHFS monovalent cation binding sites and thermostability of N10-formyltetrahydrofolate synthetase from Moorella thermoacetica. Biochemistry. 2000 Nov;39(47) 14481-14486. doi:10.1021/bi001577w. PMID: 11087401,

[2] http://www.ebi.ac.uk/intenz/query?cmd=SearchEC&ec=6.3.4.3.