Учебный сайт Гусевой Екатерины

О ФББ	Главная страница	Oбо мне	Семестры

Первый семестр

Краткое описани АДФ-рибозо-пирофосфотазы Arthrobacter sp. A3

АДФ-рибоза-пирофосфотаза (ЕС 3.6.1.13) является ферментом, который катализирует реакции гидролиза, в которых вода нуклеофильно атакует АДФ-рибозу, в результате чего получаются AMФ и D-рибоза-5-фосфат. Ферментативный гидролиз происходит при разрыве фосфоангидридной связи и зависит от ионов Mg²⁺, которые содержаться в комплексе фермента.^[1]
Далее представлена аминокислотная последовательность белка.

>ALV47582.1 ADP-ribose pyrophosphatase
MESQTFVSAANISERQALPPALAISTVIFALRPSEMSGRPTLWLPLVRRIREPFKDLWAL
PGGPLAQADSLLDAAARNLQDTTGLAPNYLEQLYAFGGLHRSPSQRVVSIGYWALVRSTQ
ADLAQETENVKWFRADGLQTLAFDHNEIVDYALWRLRNKMTYGSIAYHLLGETFTLAQVR
EVYEAVLNRSIDPANFRRQLKQTAHIEATDEFLQGGKHRPPRLYRYTGERAGDQPGSPHS
RL

Таблица 1. Описание АДФ-рибозо-пирофосфотазы из генома бактерии Arthrobacter sp. A3 ^[2]

Параметр	Значение
Идентификатор белка	ALV47582.1
Идентификатор генома	CP013745
Координаты гено в геноме	2390343..2391071
Длина гена в парах нуклеотидов	729 bp
Цепь (прямая или обратная)	Обратная цепь
Длина белка (в аминокислотных остатках)	242

Как видно по рис. 1, нуклеотидная последовательность считывается с комплементарной цепи, при этом рамка считывания -2. Если посмотреть на расположение двух соседних генов, то можно заметить, что перекрвания не происходит. Стартовый кодон данного гена- AUG (он соответствует аминокислоте метионин), а стоп-кодон - TAG.
Рис. 1. Геномное окружение белка АДФ-рибозо-пирофосфотазы. ^[3]