Филогенетические деревья




Занятие 1. Филогенетические деревья

Отобранные бактерии

Отобранные бактерии
Название Мнемоника

Bacillus anthracis

BACAN

Clostridium botulinum

CLOB1

Enterococcus faecalis

ENTFA

Geobacillus kaustophilus

GEOKA

Lactobacillus delbrueckii

LACDA

Listeria monocytogenes

LISMO

Staphylococcus epidermidis

STAES

Streptococcus pneumoniae

STRPN


Скобочная формула дерева

(CLOB1,((LACDA,(ENTFA,STRPN)),(((BACAN,GEOKA),LISMO),STAES)));

Изображение дерева



http://www.megasoftware.net/

Ветви дерева

Дерево содержит пять нетривиальных ветвей:

1) {ENTFA, STRPN} vs {CLOB1, LACDA, BACAN, GEOKA, LISMO, STAES}
2) {LACDA, ENTFA, STRPN} vs {CLOB1, BACAN, GEOKA, LISMO, STAES}
3) {CLOB1, LACDA, ENTFA, STRPN} vs {BACAN, GEOKA, LISMO, STAES}
4) {BACAN, GEOKA} vs {CLOB1, LACDA, ENTFA, STRPN, LISMO, STAES}
5) {BACAN, GEOKA, LISMO} vs {CLOB1, LACDA, ENTFA, STRPN, STAES}


©Андреянова Екатерина