Киотская энциклопедия генов и геномов (KEGG)




Занятие 8. Киотская энциклопедия генов и геномов (KEGG)

Определение метаболических путей, в которых учасствует мой фермент SUOX_HUMAN

Идентификатор гена в KEGG: hsa:6821
Описание метаболических путей, ассоциированных с геном (найден всего один путь):

  • Идентификатор KEGG: hsa00920
  • Английское название: Sulfur metabolism - Homo sapiens (human)
  • Русское название: Метаболизм с участием сульфогруппы - в человеке
  • Ссылка на карту метаболического путя
  • Общей карты метаболических путей с ссылкой на "Metabolic pathways" не найдено

    • Поиск в KEGG структурных формул заданных соединений:

  • L-треонин (L-threonine), идентификатор: C00188, брутто-формула: C4H9NO3,
    структурная формула:





  • L-изолейцин (L-isoleucine), идентификатор: C00407, брутто-формула: C6H13NO2,
    структурная формула:






    • Метаболический путь от одного заданного вещества к другому

    Выбранная цепочка ферментативных реакций

    Карта: биосинтез валина, лейцина и изолейцина

    Путь: L-треонин -> L-изолейцин

    Сравнение метаболических путей у разных организмов

    Возможность выбранной цепочки ферментативных реакций в разных организмах
    Организм Цепочка реакций возможна Обоснование

    Bacillus subtilis

    да

    присутствуют все ферменты, необходимые для осуществления цепочки реакций

    Archaeoglobus fulgidus

    нет

    неизвестны гены ферментов, катализирующих 1-ую и 8-ую стадии

    Arabidopsis thaliana

    да

    присутствуют все ферменты, необходимые для осуществления цепочки реакций

    Homo sapiens

    нет

    из 14 необходимых ферментов найдены гены только для восьми


    Карта для Bacillus subtilis

    ©Андреянова Екатерина