Uniprot ID | BLAN1_KLEPN |
Uniprot AC | C7C422 |
Refseq ID | WP_004201164.1 (old YP_008110724) |
PDB ID | 4EXS |
длина (AA) | 270 |
молекулярная масса (Da) | 28499 |
рекомендуемое Unirpot название | Metallo-beta-lactamase type 2 |
Тип кластера | Описание кластера | Идентификатор кластера | Количество совпадений |
Примеры организмов |
Uniref100 | Объединяет идентичные последовательности и суб-фрагменты с минимум 11 остатками из разных организмов. |
UniRef100_C7C422 | 314 | Acinetobacter pittii Escherichia coli Providencia rettgeri |
Uniref90 | Объединяет последовательности, минимум на 90% идентичные и на 80% перекрывающиеся с самой длинной последовательностью в кластере. |
UniRef90_C7C422 | 406 |
Acinetobacter lwoffii Providencia rettgeri Pseudomonas putida |
Uniref50 | Объединяет последовательности, минимум на 50% идентичные и на 80% перекрывающиеся с самой длинной последовательностью в кластере. |
UniRef50_C7C422 | 407 | Acinetobacter calcoaceticus Enterobacter hormaechei Escherichia coli |
Все последовательности, попадающие в кластер Uniref100, попадают также в кластеры Uniref90 и тем более Uniref50: чем меньше количество требуемых совпадений, тем больше белков попадает в кластер. Поэтому наибольшее количество последовательностей содержится в Uniref50, а наименьшее - в Uniref100.
Описание | Запрос | Результат |
По рекомендованному названию организма | name:"metallo beta lactamase type 2" | Reviewed 15 - Unreviewed 5 |
по названию и семейству | taxonomy:enterobacteriaceae name:"metallo beta lactamase type 2" |
Reviewed 2 |
по названию и отделу | taxonomy:proteobacteria name:"metallo beta lactamase type 2" |
Reviewed 3 - Unreviewed 4 |
Трипсин | name:trypsin | Reviewed 301 - Unreviewed 11008 |
Ингибитор трипсина | name:trypsin name:inhibitor | Reviewed 203 - Unreviewed 2355 |
Аннонсированный ингибитор трипсина | name:trypsin annotation:(type:function inhibitor) | Reviewed 70 |
Актин | name:actin | Reviewed 1119 - Unreviewed 44367 |
Актин&Членистоногие | name:actin taxonomy:arthropoda | Reviewed 59 - Unreviewed 4866 |
Актин&Инфузории | name:actin taxonomy:ciliate | Reviewed 3 - Unreviewed 47 |