На главную

Занятие 1. Филогенетическое дерево

Отобранные бактерии

НазваниеМнемоника
Clostridium botulinumCLOBA
Lactobacillus acidophilusLACAC
Streptococcus pyogenes serotype M1STRP1
Streptococcus pneumoniae serotype 4STRPN
Enterococcus faecalisENTFA
Bacillus subtilisBACSU
Geobacillus kaustophilusGEOKA
Listeria monocytogenes serovar 1/2aLISMO

Изображение дерева

Скобочная формула дерева

(CLOBA, ((LACAC, ((STRP1, STRPN), ENTFA))), ((BACSU, GEOKA), LISMO)));

Нетривиальные ветви

  1. {BACSU; GEOKA; LISMO} против{CLOBA; LACAC; STRP1; STRPN; ENTFA}
  2. {BACSU; GEOKA} против {LISMO; CLOBA; LACAC; STRP1; STRPN; ENTFA}
  3. {LACAC; STRP1; STRPN; ENTFA} против {CLOBA; BACSU; GEOKA; LISMO}
  4. {STRP1; STRPN; ENTFA} против {LACAC; CLOBA; BACSU; GEOKA; LISMO}
  5. {STRP1; STRPN} против { ENTFA; LACAC; CLOBA; BACSU; GEOKA; LISMO}

Соответствие нетривиальных ветвей таксонам

  1. Bacillales
  2. Bacillaceae
  3. Lactobacillales
  4. -
  5. Streptococcus

Занятие 2. Реконструкция филогении