Для анализа был выбран домен DCB (PF16213). Он является N-концевым доменом Mon2- и BIG1-подобных белков. Эти белки играют важную роль в мембранном транспорте и гомеостазе комплекса Гольджи.
Выравнивание выбранного семейства доменов в формате fasta, проект Jalview.
Выбранные доменные архитектуры:
Краткое описание доменов:
Sec7 (PF01369)
Белки, содержащие данный домен, являются факторами обмена гуаниновых нуклеотидов. Они встречаются у всеех эукариот и участвуют в перестройке мембран по всей клетке.
Sec7_N (PF12783)
Фактор обмена гуаниновый нуклеотидов при транспорте через аппарат Гольджи N-концов.
DUF1981 (PF09324)
Представители данного семейства являются функционально не описанными доменами, которые встречаются в различных транспортных белках растений и дрожжей.
Таблица с данными по всем белкам Uniprot, включающих выбранный домен, и описанием нашей выборки.
Обозначения: 2 - последовательности, входящие в двухдоменную архитектуру (DCB, DUF1981); 3 - последовательности, входящие в трехдоменную архитектуру (DCB, Sec7_N, Sec7). E - последовательности представителей Ecdysozoa, C - последовательности представителей Chordata.
