Химическое строение нуклеиновых кислот

Скачать файл с выполненными заданиями практикума

Основным заданием данного практикума было научиться пользоваться программой ChemSketch (редактор, с помощью которого можно получить графические изображения структур химических веществ). Для этого предлагалось построить структуры 2'-дезоксигуанозиндифосфата, 2'-дезокситимидинмонофосфата, уридина, псевдоуридина. Полученное мной изображение представлено на рис. 1.

Рис. 1. Графическое изображение структур 2'-дезоксигуанозиндифосфата, 2'-дезокситимидинмонофосфата, уридина, псевдоуридина. Атомы углерода пронумерованы синими цифрами. Красным цветом выделены атомы, образующие N-гликозидную связь. Изображение получено с помощью программы ChemSketch.

Далее требовалось построить изображение фрагмента двухцепочечной ДНК. Полученный результат вы можете увитдеть на рис. 2.

Рис. 2. Графическое изображение фрагмента двухцепочечной ДНК. Водородные связи показаны пунктирными линиями. Нуклеотиды подписаны однобуквенными обозначениями зелёного цвета. Красным выделен сахарофосфатный остов. Стрелочками показано направление цепи. Изображение получено с помощью программы ChemSketch.

Дополнительным заданием было построить канонические и неканонические пары для заданного азотистого основания (мне попался тимин). Изображение построенных мной структур представлено на рис. 3.

Рис. 3. Каноническая пара тимин-аденин. Неканонические пары с тимином. Водородные связи показаны пунктирными линиями. Нуклеотиды подписаны однобуквенными обозначениями зелёного цвета. Изображение получено с помощью программы ChemSketch.

Существование структур, показанных на рис. 3. кажется вполне вероятным, т. к. водородные связи в них имеют одинаковую длину и геометрию (выбирались именно те структуры, в которых расстояния между атомами, образующими водородную связь, были одинаковыми).