1)
команда "ls"
(Term_1  Term_2  public_html  winscp.RND)
показывает содержимое моей домашней директории на сервере kodomo.

команда "ls .." показывает содержимое родительской директории.

команда "cd . ." осуществляет переход в родительскую директорию, 
а дальнейшая команда "ls" отображает объекты, находящиеся в ней.
Данную операцию можно повторить всего 4 раза, пока мы не "упремся" в корневую папку.

команда "pwd"  пишет полный адрес моей директории в командной строке.

2)
в активной директории Pr_5 командой "seqret sw:p77791 -auto"
создается файл maa_ecoli.fasta с последовательностью аминокислот в фаста-формате,
посмотреть его содержание мы можем с помощью соответствующей команды "more".

командой "entret sw:p33221 -auto" создается файл maa_ecoli.entret с записью PDB о белке, 
при его просмотре командой "more maa_ecoli.entret" отображается небольшая часть документа, 
нажатие клавиши Enter выводит на экран еще одну строку документа, а пробела - сразу несколько строк.

3)
нажатие стрелок вверх и стрелок вниз поволяет увидеть в командой строке предыдущие команды и использовать их.
команда history выводит список всех использованных команд в том порядке, в каком они были использованы.

если в директории имеется файл, первая буква которого отличается от первой буквы всех остальных файлов, 
можно его вызвать, набрав more [первая буква], и нажать tab - имя фала выводится целиком.