Примеры различных контактов в молекуле белка XynD_Bacsu
Донором и акцептором водорода являются атомы кислорода: Asn326A.OD1 и Tyr324A.OH;
Донором и акцептором водорода являются атомы азота: His230A.NE1 и His330A.NE1.
Гидрофильность, гидрофобность (от гидро… и греч. philia—любовь, от гидро… и греч. pholos — боязнь, страх) — характеристики интенсивности молекулярного взаимодействия поверхности тел с водой. Понятие гидрофильность, гидрофобность относится не только к телам, у которых оно является свойством поверхности, но и к отдельным молекулам, их группам, атомам, ионам. Гидрофильностью (хорошей смачиваемостью водой) обладают вещества с ионными кристаллическими решётками (оксиды, гидроксиды, силикаты, сульфаты, фосфаты, глины и т. д.), вещества с полярными группами —ОН, —СООН, —NO2 и др. Гидрофобностью (плохой смачиваемостью) обладают большинство органических веществ с углеводородными радикалами, металлы, полупроводники и т. д. Гидрофильность, гидрофобность являются частным случаем отношения веществ к растворителю © ru.wikipedia.org
Дисульфидные мостики, или диcульфидная связь — ковалентная связь между двумя атомами серы, входящими в состав серусодержащей аминокислоты цистеина. Дисульфидные связи образуются в процессе посттрансляционной модификации белков и служат для поддержания третичной и четвертичной структур белка © ru.wikipedia.org
Примечание: данный сульфидный мостик принадлежит инсулину. В белке XynD_Bacsu дисульфидных мостиков не обнаружено