Имя атома контакта | Имя контактирующего атома белка | Расстояние в Å | Предположительная природа контакта |
Ca 3704 (атом кальция) |
Asp480A.O | 2.48 | Электростатическое взаимодействие |
Ca 3704 (атом кальция) |
Glu361A.OE1 | 2.33 | Электростатическое взаимодействие |
Ca 3704 (атом кальция) |
Glu359A.OE1 | 2.51 | Электростатическое взаимодействие |
Ca 3704 (атом кальция) |
Glu361A.OE2 | 2.50 | Электростатическое взаимодействие |
Ca 3704 (атом кальция) |
Asn383A.OD1 | 2.39 | Электростатическое взаимодействие |
Ca 3704 (атом кальция) |
Gln384A.O | 2.37 | Электростатическое взаимодействие |
Ca 3704 (атом кальция) |
Asp480.OD1 | 2.35 | Электростатическое взаимодействие |
Собственно изображение лиганда
Считаю, что стоит отметить одну странную деталь. При выводе лиганда командой restrict within (5.0, Ca) я получил следующую картину:
Аналогично при выборе в качестве лиганда двух различных атомов натрия (restrict within (5.0, Na)
Является это особенностью белка или же это ошибка программы или составителя схемы - утверждать не могу. Однако данный результат противоречит законам химии.