Таблица. Контакты атома Ca с белком XynD_Bacsu.

Имя атома контакта Имя контактирующего атома белка Расстояние в Å Предположительная природа контакта
Ca 3704
(атом кальция)
Asp480A.O 2.48 Электростатическое взаимодействие
Ca 3704
(атом кальция)
Glu361A.OE1 2.33 Электростатическое взаимодействие
Ca 3704
(атом кальция)
Glu359A.OE1 2.51 Электростатическое взаимодействие
Ca 3704
(атом кальция)
Glu361A.OE2 2.50 Электростатическое взаимодействие
Ca 3704
(атом кальция)
Asn383A.OD1 2.39 Электростатическое взаимодействие
Ca 3704
(атом кальция)
Gln384A.O 2.37 Электростатическое взаимодействие
Ca 3704
(атом кальция)
Asp480.OD1 2.35 Электростатическое взаимодействие

Собственно изображение лиганда

Считаю, что стоит отметить одну странную деталь. При выводе лиганда командой restrict within (5.0, Ca) я получил следующую картину:

Аналогично при выборе в качестве лиганда двух различных атомов натрия (restrict within (5.0, Na)

Является это особенностью белка или же это ошибка программы или составителя схемы - утверждать не могу. Однако данный результат противоречит законам химии.