α-спиралей - 4
β-тяжей - 55
β-поворотов - 59
Белок относится к β-белкам, так как количество β-складок и β-поворотов более чем в 13 раз больше, чем количества α-спиралей, плюс длина α-спиралей незначительна
Выбрана α-спираль 307-315
Спираль выделена красным цветом
Только эта спираль
Остов спирали с водородными связями. Номера Cα атомов подписаны
На картинку добавлены Cβ атомы в виде красных шариков
H-паттерн: (307,311); (308,312); (309,313); (310,314); (311,315). Альтернативная запись: (i,i+4), где i={307...311}
Cβ атомы перпендикулярны спирали (углы кажутся прямыми на изображении №4)
Выбран β-тяж 407-415 как основной и β-тяжи 449-454 и 478-486 как вспомогательные
Выбранные тяжи окрашены по структуре
Только выбранные тяжи
Остов тяжей с водородными связями. Номера C7alpha; атомов подписаны
На картинку добавлены Cβ атомы в виде красных шариков
В расположении Cβ атомов упорядоченность найти не удалось. Расположены вне какой-то одной плоскости
Прошу обратить внимание, что нумерация атомов центрального тяжа идет снизу-вверх, а правого - сверху-вниз. Этот бета-поворот я рассмотрю ниже
Выбран β-поворот 427-432, так как он взаимосвязан с рассмотренными выше β-тяжами
Остов поворота жирно выделен
Поворот скрепляет лишь одна водородная связь (428,431)
Структура поворота: Asp427Ser428Ala429Asp430Gly431Lys432