Muscle и GeneDoc

Впечатление от увиденного: впечатлило... В первый миг у меня зарябило в глазах от широких черных полос с белыми буквами, перемешанными с белыми полосами.

Впечатление испортил гэповый конец, он сильно портит картину.

Выравнивание гомологов белка

Участки с повышенной консервацией существуют, отмечу 4 наиболее крупные

Выравнивание

Координаты
№1 56-66
№2 203-221
№3 291-309
№4 368-386

Недостоверные участки также есть, скажем:
Координаты
185-193
556-574

Mafft

Впечатление: Японская программа понравилась больше, приятно сгруппировав последовательности так, чтобы гэповые хвосты были в одной кучке.