UCSC

С помощьюгеномного браузера UCSC был произведён поиск фосфофруктокиназы человека. Информация о гене:
Полное имя гена - Human muscle phosphofructokinase, короткое - PFKM. Закодирован на прямой цепи. Находится в 12-й хромосоме. Плечо и полоса - chr12:q13.11. Координаты гена в хромосоме - 48,120,104-48,146,865. В гене закодировано 11 альтернативных продуктов. 1-й продукт - 23 экзона, 40,941 а.о. 2-й продукт - 23 экзона, 40,291 а.о.. 3-й продукт - 21 экзон, 40,007 а.о. Ниже представлено изображение из геномного браузера UCSC.

Ensembl

Для выполнения задания ген PFKM человека был найден в геномном браузере Ensembl; Далее ген человека был выровнен с соответствующим геном шимпанзе; Далее получен файл с полиморфизмами, которых окалаось 11881, и с помощью программы distmat посчитана дистанция между генами: 322

Полезные ссылки:

Главная страница;

Профайл;

Учебные реалии, или список семестров;

Официальный сайт ФББ МГУ.

© Daniel Igumnov, 2018