Ссылка на базу данных KEGG
Идентификатор: map00300
Лизин - незаменимая для человека протеингенная аминокислота.
Дефекты обмена лизина проявляются тремя состояниями: гиперлизинемией , альфа-аминоадипиновой ацидемией и альфа-кетоадипиновой ацидемией.
Метаболический путь может начинаться с L-аспартата, ацетила-КоА или 2-оксиглутарата (отмечены зелёным на картинке выше).
Процессы, приносящие вещества в метаболический путь лизина, отмечены оранжевым цветом.
Синим отмечены метаболитческие пути, заимствующие вещества из метаболического пути лизина.
MurE synthetase (отмеч красным) участвует в построении клеточной стенки.
Таксономия: Archaea; Euryarchaeota; Thermococci; Thermococcales; Thermococcaceae; Pyrococcus; Pyrococcus kukulkanii
Мы видим наличие только 4-х ферментов, поэтому можно предположить, что данная архея, как и археи в целом, не способны осуществлять данный метаболический путь.
Таксономия: Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Malpighiales; Euphorbiaceae; Acalyphoideae; Acalypheae; Ricinus; Ricinus communis.
Единственный представитель рода Клещевина - Клещевина обыкновенная, семейство Молочайные.
Мы видим полное осуществление цепочки синтеза L-лизина с начальным метаболитом в виде L-аспартата.
Таким образом, можно сказать, что растения способны использовать данный путь, так как присутсвуют все необходимы ферменты ждя последовательных реакций одной из цепочек.
Таксономия: Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacterales; Enterobacteriaceae; Klebsiella; Klebsiella pneumoniae; Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae.
Клебсиелла пневмонии, или палочка Фридлендера, названная в честь впервые выделившего её в 1882 году немецкого ученого.
Бактерии также способны осуществлять синтез L-лизина, но цепочка реакций имеет немного иной вид.
В отличие от растений, метабоилческий путь бактерий также способен донировать метаболиты в синтез пептидогликанов и участвоватб в синтезе клеточной стенки.
Как видно из приведенных данных, бактерии и растения, в отличие от архей, способны фрагментарно, но не полность, осуществлять цепи метаболического пути синтеза лизина.
Ссылка на страничку в баззе данных KEGG
Идентефикатор: R04198
Реакция обозначены сиреневым цветом на картинке метаболического пути.
Схема реакции представлена ниже.
Учебные реалии, или список семестров;
© Daniel Igumnov, 2018