- Работа с Pymol
- Cеми-эмпирические вычисления: Mopac
- Abinitio вычисления для нафталина и азулена
- Вычисление параметров для молекулярной механики
- Изучение работы методов контроля температуры в GROMACS
- Молекулярная динамика биологических молекул в GROMACS
- Анализ молекулярной динамики биологических молекул в GROMACS (in progress)
- Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом
- Докинг низкомолекулярных лигандов в структуру белка
- Макромолекулярный докинг (in progress)
- Расчёт энергии сольватаци димера из двух мономеров полиэтиленгликоля методом FEP (in progress)
- Пример использования трехмерного QSAR анализа для предсказания активности низкомолекулярных соединений в отношении данного белка