Задание 1

Отобранные бактерии

При помощи питоновской команды random.choices(...) я отобрал 7 следующих бактерий:

1) Brucella suis - BRUSU

2) Paracoccus denitrificans - PARDP

3) Burkholderia mallei - BURMA

4) Thiobacillus denitrificans - THIDA

5) Acidiphilium cryptum - ACICJ

6) Yersinia pestis - YERPE

7) Polynucleobacter asymbioticus - POLAQ

Скобочная форма дерева

((ACICJ, (BRUSU, PARDP)), ((THIDA, (POLAQ, BURMA)), YERPE));

Изображение дерева

Ветви дерева

Дерево содержит 4 нетривиальные ветви:

1) {BRUSU, PARDP} против {ACICJ, THIDA, POLAQ, BURMA, YERPE}

2) {ACICJ, BRUSU, PARDP} против {THIDA, POLAQ, BURMA, YERPE}

3) {ACICJ, BRUSU, PARDP, YERPE} против {THIDA, POLAQ, BURMA}

4) {ACICJ, BRUSU, PARDP, YERPE, THIDA} против {POLAQ, BURMA}

Задание 2

Таксономия

При помощи NCBI я выяснил, что Yersinia pestis относится к Гамма-протеобактериям, нетривиальная ветвь {ACICJ, BRUSU, PARDP} к Альфа-протеобактериям, а ветвь {THIDA, POLAQ, BURMA} к Бета-протеобактериям. Среди Альфа-протеобактерий выбранные представители принадлежат разным отрядам, а среди Бета-протеобактерий нетривиальна ветвь {POLAQ, BURMA} относится к отряду Burkholderiales, семейству Burkholderiaceae.