Advanced search в PDB

1а.

Я искала все лиазы из организма Mus Musculus. Запрос выглядел так: Taxonomy is just Mus musculus (house mouse) and EnzymeClassification is 4: Lyases. Нашлось 24 белка.

Скачала Excel-таблицу , содержащую следующую информацию о полученных белках (Reports -> Custom Reports -> Customizable Table):
название структуры; (Structure Summary: PDB POI)
метод решения; (Structure Summary: Experimental Method)
разрешение; (Structure Summary: Resolution)
разрешение метода EM; (EM Structure Report: EM Resolution)
классификация; (Biological Details: Source, EC Number)
главная публикация; (Primary Citation, все поля)

Хочу заметить, что в таблице 45 строк, потому что информация про кажду цепь записалась в отдельную колонку.

1б.

Все последовательности (архив) , удовлетворяющие этим критериям (Download: sequences).

1с.

Структуры (архив) всех последовательностей. Download: Coordinates&Experimental Data, галочки у полей PDB и uncompressed (иначе скачивает 24 архива).