Мутагенез

Визуализация зоны контакта 1lmp с лигандом (рис.1). Скрипт.

Рис. 1. Зона контакта с лигандом

Введение мутации: замена ASN 103 на GLY => потеря связывания с лигандом (рис. 2). Скрипт.

Рис. 2. Замена 103 аспарагина на глицин.

Создание анимационного ролика: совмещение белков + место мутации

Ссылка на ролик. Скрипт.

Построение структуры кубана с помощью программы babel

на основе его SMILES-нотации: C12C3C4C1C5C2C3C45

echo C12C3C4C1C5C2C3C45 > cubane.smi

obgen cubane.smi > cubane.mol

Рис. 3. Структура кубана.

Построение поли-аланиновой альфа-спирали

Изображена на рис. 4. Скрипт.

Рис. 4. Поли-аланиновая альфа-спираль.