KEGG. Метаболические пути
1. В данном задании мне достался метаболический путь с номером 00340.Б
В полученном пути я выбрала реакцию с номером R04066.
Уравнение реакции: 4-имидазол ацетат + O2 + NADH + H+ <=> 4-имидазолон-5-ацетат + NAD+ + H2O
Данную реакцию катализирует фермент имидазолацетат-4-монооксигеназа (код фермента EC 1.14.13.5).
Разберем, что обозначает код фермента:
- 1 - оксидоредуктазы
- 1.14 - ферменты, включающие в два окисляемых субстрата (доноры электронов) один атом кислорода
- 1.14.13 - ферменты, действующие на парных доноров с включением или восстановлением молекулярного кислорода. Введенный кислород не обязательно должен быть производным O2. С НАДН или НАДФН в качестве одного донора и включением одного атома кислорода.
- 1.14.13.5 - наш фермент
Далее посмотрим на этот метаболический путь в двух конкретных организмах: Sus scrofa (кабан) и Felis catus (домашняя кошка).
Для Felis catus нашлось 339 метаболических путей, 19748 белок-кодирующих генов и 1854 РНК-генов. (Информация получена тут.)